כחלק מהרצון והניסיון להעניק לסטודנטים אוירה ישראלית ביתית ויהודית גם בחו”ל – נערכים אנשי המרכז גם לקראת החגים על מנת לספק לסטודנטים היכרות עם החג הממשמש ובא. לקראת חג הסוכות נבנית במקום סוכה כשרה ונרכשים ארבע מינים מהודרים. במהלך החג נערכות במרכז סעודות חגיגיות ועשירות במיוחד במהלכן מתוודעים הסטודנטים למהות החג ולמשמעותו על טקסיו וסמליו. בסוכות מארח המרכז גם את קהילת היהודים המבוגרים המועטים המתגוררים בקובנה. בני הקהילה, שזיכרונות מבית אבא עדיין קיימים אצלם – שמחים להתארח במרכז היהודי, ליטול ארבע מינים בברכה ולחוות את חג הסוכות באווירה יהודית חגיגית וביתית.
