המרכז היהודי מקפיד לשמור על קשר רציף עם הגופים הממשלתיים של מדינת ישראל. כך גם דואגים במרכז לקיום מערכת קשרים סדירה עם השגריר הישראלי בליטא. השגריר מגיע מידי כמה חודשים לביקור במרכז ונפגש עם אנשי הצוות ועם הסטודנטים. מידי ביקור מתקיים מעין “פאנל” בין השגריר לבין הסטודנטים, בו הסטודנטים הפורשים ומציגים את בקשותיהם וטענותיהם בפני השגריר. השגריר מצדו מקשיב לדברים ומבטיח את טיפולו ומלא תשומת ליבו. עבור כל סטודנט ישראלי הלומד בחו”ל, המהווה בעצמו מעין שגריר של מדינת ישראל, גורם כל ביקור כזה לחיבור חשוב נוסף עם ישראל – מולדתו הרחוקה.
