לקראת ראש השנה ויום הכיפורים נערכים במרכז היהודי על מנת לספק ולהעניק לסטודנטים היהודיים את האפשרות לחוות את הימים הללו כראוי. בראש השנה נערך הטקס סביב שולחנות ערוכים וחגיגיים במיוחד בתפוסה מלאה. הסעודה מתנהלת תוך מתן הסברים אודות מנהגי החג, הסימנים ומשמעותם ומהות היום. הסעודות נערכות באווירה חגיגית ומרוממת, עם שפע של מטעמים ואוכל משובח. בימי החג מתקיימות במקום כל תפילות החג ותקיעות שופר.
מנהג ה”תשליך” מתקיים על שפת נהר הניימן תוך הסבר על טעם המנהג.
ימי ראש השנה עוברים על הסטודנטים באווירה חגיגית, מרוממת וקסומה במיוחד.
ביום הכיפורים נערכות במקום הרצאות שנמסרות מפי מרצים אורחים שמגיעים במיוחד למרכז. זאת בנוסף לתפילות היום הנערכות גם הן במקום. הודות לפעילות מאומצת ומסורה של אנשי המרכז היהודי מתאפשרת ביום כיפור היעדרות של הסטודנטים היהודים משיעורים ובחינות באוניברסיטה המקומית, מה שמקל על הסטודנטים את ההשתתפות בהרצאות ובתפילות של היום הקדוש.
